تم اقتطاع قطاع غزة فجأة عن فلسطين التاريخية عام 1948. ووقعت المنطقة تحت الإدارة العسكرية المصرية حتى عام 1967. ومرة أخرى، رافق هذا التطور تأثيرات اجتماعية واقتصادية درامية.
كان قطاع غزة يفتقر للقدرات الاجتماعية الاقتصادية الكافية والقادرة على استيعاب الأعداد الكبيرة من اللاجئين الفلسطينيين. وبالمثل، كانت مصر تفتقر للوسائل. وكانت أنشطة منظمة الأمم المتحدة لإغاثة وتشغيل اللاجئين الفلسطينيين في الشرق الأدنى (الأونروا) ذات أهمية حاسمة لبقاء مئات الآلاف من اللاجئين الفلسطينيين على قيد الحياة.
من غزة، نظم مقاتلو الميليشيات الفلسطينية (الفدائيون) هجمات مسلحة على إسرائيل. وبالمقابل، ردت إسرائيل على النيران ونظمت هجمات مسلحة. وكان ذلك مجرد بداية لما كان سيأتي.
في ضربة افتتاحية في ما يسمى بأزمة السويس – هجوم القوات المسلحة الفرنسية والبريطانية والإسرائيلية على مصر بهدف القضاء على حكم الرئيس جمال عبد الناصر – احتلت إسرائيل قطاع غزة في نهاية تشرين الأول/أكتوبر عام 1956. وعلى الرغم من اضطرار إسرائيل للانسحاب تحت ضغط أمريكي، استمر الاحتلال خمسة أشهر. كان ذلك كافياً للجيش الإسرائيلي لتتبع الفدائيين منهجياً، والذين تم تصفيتهم في كثير من الحالات أو أخذهم كأسرى إلى إسرائيل.
على الرغم من أن السلطات المصرية أحكمت السيطرة على الفلسطينيين، إلا أنها قدمت لهم فرص التعليم والعمل في مصر. وكان بإمكانهم دخول البلاد والخروج منها بوثائق سفر مصرية مخصصة للاجئين الفلسطينيين من قطاع غزة.